Optimización de un protocolo de PCR convencional para detectar los viroides Avocado sunblotch viroid (ASBVd) Y Potato spindle tuber viroid (PSTVd) de Persea americana Mill

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María Valderrama Valencia Miguel Angel Nieto-Taype Berly Cárdenas Pillco

Resumen

El palto (Persea americana Mill) es una planta de interés alimenticio, cuyo problema a nivel del cultivo son las enfermedades que reducen tanto la calidad fitosanitaria y post-cosecha; de entre ellos tenemos a los producidas por los viroides, entre ellos se tiene al Avocado sunblotch viroid (ASBVd) y el Potato spindle tuber viroid (PSTVd) quienes disminuyen dramáticamente las propiedades organolépticas del fruto. Durante el proceso de producción de dicho cultivo es necesario contar con plantones libres de patógenos lo que hace necesario su temprana detección. En la actualidad existen métodos de detección cuyo costo aproximado es de 24 USD a través del uso de la técnica de PCR tiempo real.
En la búsqueda de métodos de detección más baratos y confiables se llevó a cabo la estandarización de un protocolo de PCR convencional que permita disminuir el costo de detección de viroides en plantas madre de palto. Para ello se hizo uso de la técnica de Retrotranscriptasa reversa acoplada la reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR) tiempo final haciendo uso de los kit One-Step RT-PCR (Novagen) y Two-step (Promega), siendo el segundo el ofreció el mejor resultado. Finalmente se logró amplificar las bandas que identifican a los viroides empleando la técnica de PCR tiempo final, reduciendo así el costo de detección a un aproximado de 12 USD por muestra.

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VALDERRAMA VALENCIA, María; NIETO-TAYPE, Miguel Angel; CÁRDENAS PILLCO, Berly. Optimización de un protocolo de PCR convencional para detectar los viroides Avocado sunblotch viroid (ASBVd) Y Potato spindle tuber viroid (PSTVd) de Persea americana Mill. Veritas, [S.l.], v. 15, n. 1, p. 45-50, jun. 2017. ISSN 1684-7822. Disponible en: <https://revistas.ucsm.edu.pe/ojs/index.php/veritas/article/view/4>. Fecha de acceso: 02 feb. 2023 doi: https://doi.org/10.35286/veritas.v15i1.4.
Sección
Área de Ciencias Tecnológicas e Ingenierías